Руфин Судковский родился 19 (7 по старому стилю) апреля 1850 года в городе Очаков, Херсонской губернии Российской империи. Руфин был сыном священника и сам готовился стать таковым, но в юношестве его перестала привлекать идея церковной службы, после чего Судковский начал учиться живописи и рисунку.

Получив базовое художественное образование в Одессе, Руфин Судковский поступил в Императорскую Академию художеств. После нескольких лет обучения в академии, Руфин вернулся в Очаков, где оставался до самой своей смерти.

Во второй половине 1870-х годов художественные старания Руфина Гавриловича Судковского были замечены и ему присвоили звание классного художника 1-й степени.

Самой известной работой Р. Г. Судковского является "Мёртвый штиль" (Прозрачная вода) (1879 - 1885). С этой картиной был связан крупный скандал, разделивший тогда художественную общественность на два враждующих лагеря.

Женой Руфина Судковского была художница Бенард (Самокиш-Судковская) Елена Петровна.

Руфин Гаврилович Судковский умер 16 (4 по старому стилю) 1885 года в родном Очакове в возрасте 34 лет.